Type de ressources génétiques

• Plant genetic resources (PGR)

Historique de la base de données

Date de mise en place de la base de données: 2001 – 2010
Motivations pour la création de la base de données: Le premier objectif était de créer un catalogue des accessions conservées et mises à disposition par les Centres de Ressources Génétiques de l’Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) et de le mettre en réseau avec les grands catalogues internationaux (EURISCO, GBIF). Le deuxième objectif est de lier ces accessions à des données de génotypage et de phénotypage et de contribuer à l’infrastructure européenne pour la recherche ELIXIR.

Contenu de la base de données

Origine géographique prédominante ddu matériel dans la base de données: National
Type de collections/populations géré dans la base de données:

• ex situ

Nombre total d’accessions documentés :

• 26892

Type de données incluses dans la base de données :

• Passport data
• Phenotypic data
• Genetic (genes, markers, sequences) data
• distribution via a SMTA

Evolution du nombre d’enregistrements/accessions dans la base de données au cours des 10 dernières années : Forte augmentation

Utilisation de la base de données

Nombre annuel moyen d’utilisateurs

Utilisateurs internes: 1327
Utilisateurs externes: 569
Fréquence de consultation de la base de données: >100 fois
Évolution du nombre d’utilisateurs au cours des 10 dernières années: Forte augmentation

Interface utilisateur

Options d’accès à la base de données:

• Externe via internet mais sur la base d’un accès restreint
• Accès public via internet
• Jeux de données téléchargeables via internet

La DB est-elle accessible en anglais? Oui

Outils

Types d’interfaces:

• REST

Logiciel de gestion de la base de données : Oracle
Nom du serveur Web: Appache – TOMCAT
Nom du système de gestion du contenu de la base de données: BDD relationnelle